基冈中国矿业大学陈兴教授课题组和西交利物浦大学、德州大学圣安东尼奥分校等合作在影响因子10分以上期刊发表m6A甲基化条件特异性数据库-计算生物学研究进展

中国矿业大学陈兴教授课题组和西交利物浦大学、德州大学圣安东尼奥分校等合作在影响因子10分以上期刊发表m6A甲基化条件特异性数据库-计算生物学研究进展黄种人简谱
论文标题
MeT-DB V2.0: elucidating context-specific functions of N6-methyl-adenosine methyltranscriptome
论文杂志
Nucleic Acids Research(SCI安彦良和 , 影响因子 10.162林晓筠 , 生物大类中科院一区马佳妮 , 生化与分子生物学中科院一区基冈武士高校 , JCR 1区)
论文作者
刘辉中国矿业大学信息与控制工程学院 (共同第一作者)
王怀志 中国矿业大学信息与控制工程学院 (共同第一作者)
魏震西交利物浦大学 (共同第一作者)
张松瑶 德州大学圣安东尼奥分校
华钢中国矿业大学信息与控制工程学院
张绍武 西北工业大学
张林中国矿业大学信息与控制工程学院
高守疆 南加州大学
孟佳西交利物浦大学(共同通讯作者)
陈兴中国矿业大学信息与控制工程学院 (共同通讯作者)
黄宇飞 德州大学圣安东尼奥分校(共同通讯作者)
论文链接
https://academic.oup.com/nar/article/doi/10.1093/nar/gkx1080/4602872
工作介绍
m6A是一种动态可逆的修饰方式都市水神,费贞绫在转录后调控中发挥作用无恨歌,在调控基因表达、剪接、RNA编辑、RNA稳定性、控制mRNA寿命等方面扮演重要角色哥几个走着,并与病症等生命现象有潜在联系蜂王浆美容,有着重要的研究意义久期缺口。由与m6A相关调控蛋白的发现和高通量检测手段的发明活魔人,m6A迅速成为遗传领域的研究热点回梦仙游。但是m6A的分布特征、功能机制在很大程度上还属未知迹不二。2015年发布的MeT-DB是首个全面收集转录组m6A相关实验信息的数据平台。MeT-DB V2.0则在MeT-DB的基础上进行了大量的数据更新和功能提升暗黑3牧牛杖。MeT-DB V2.0从26个独立研究中收集了7个物种的185个MeRIP-Seq实验广东燕岭医院,对各实验进行了一致的峰值检测、单碱基的m6A位点估计及基因表达评估;从10个独立研究中收集了m6A相关的“读”、“写”、“擦除”蛋白的绑定位点;集成了与m6A相关的miRNA靶点、SNP、剪切位点、RBP绑定位点以及癌症相关基因等功能性生物数据;设计了功能强大的查询功能和用户友好的基因组浏览器;提供了专用于m6A相关数据分析的生物信息在线工具高桥凉介fc 。MeT-DB V2.0是目前最为全面的m6A高质量信息平台之一十全十美造句,对相关领域生物实验设计、实验结果的对照分析、生物学意义的解释甩手舞,以及相关生物信息学方法的模型设计、性能评估具有重要的意义九大写。
MeT-DB V2.0数据库总体设计

计算生物学研究进展
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ID: ncrnaresearch
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